El proyecto se centra en la evaluación ecológica de masas de agua siguiendo la Directiva Marco del Agua (DMA), que exige monitorear la calidad biológica mediante bioindicadores como peces, plantas acuáticas y macroinvertebrados. Tradicionalmente, la identificación de peces en ríos se realiza mediante métodos invasivos como la pesca eléctrica, lo cual puede ser insuficiente para detectar especies exóticas o invasoras. Para superar estas limitaciones, LTL propone el uso de DNA ambiental (eDNA) y técnicas de metabarcoding para identificar especies ibéricas de peces de agua dulce. Este enfoque permite identificar especies a partir de fragmentos de DNA sin necesidad de capturarlas, ofreciendo ventajas como evitar daños a la fauna y mejorar la precisión en la identificación. Este método permite la identificación de especies mediante fragmentos cortos de DNA y cebadores universales basados en secuencias taxonómicamente conservadas. Este esfuerzo tiene importancia para la gestión medioambiental de acuerdo con la DMA y la Directiva de Hábitats (DH).