La flota pesquera andaluza está compuesta actualmente por un total de 1.982 barcos, que lograron en 2006 un volumen de capturas de 76.811 toneladas, de las cuales 70.292 toneladas corresponden a pesca fresca, 5.821 toneladas a pesca congelada y 698 toneladas a pesca de almadraba. El valor total de producción es de 216 millones de euros al año.
En cuanto a la acuicultura, existen 94 empresas dedicadas a esta actividad en territorio andaluz (el 82% se encuentran en las provincias de Cádiz y Huelva, con 41 y 36 empresas respectivamente), de las que 78 cuentan con instalaciones en tierra y 16 con instalaciones en el mar. El volumen total de producción de las mismas en 2007 fue de 8.000 toneladas, 831 toneladas de moluscos, 129 toneladas de crustáceos, 7.040 toneladas de peces y 1,5 toneladas de microalgas, con un valor de producción global de 61 millones de euros.